醫用氧和工業氧雖然都是氧，但它們有著本質的區別。
工業氧：指的是工業上使用的氧氣，一般要求含氧純度，其它的就沒什么要求，主要用于焊接、氣焊、氣割等等。同時，工業氧里面還含有超標的一氧化碳、甲烷等有害氣體。工業氧是用于工業生產及產品加工的氣體，質量要求較低一般要求純度在99%以上為合格。在壓縮沖裝過程中有呈酸性或堿性的潤滑水帶入鋼瓶，會導致鋼瓶內壁銹蝕，從而使瓶內氣體帶有異味。醫用氧氣是指采用深冷分離法將大氣中氧氣分離以供應醫療救治病人使用的氧氣。適用于因缺氧引起的呼吸系統疾病 (如哮喘、支氣管炎、肺心病等)、心臟及腦血管系統疾病 (如：冠心病、心肌梗塞、腦溢血、腦梗塞) 的輔助治療，以緩解其缺氧癥狀； 也可用于保健吸氧或緊張腦力勞動及體力勞動后疲勞的快速解除。因此，國家藥品監管部門一直把醫用氧列入藥品來管理，要求生產、經營醫用氧都要取得許可證。